Dans la structure de programmes dans e!COCKPIT, aucune application n'est créée pour les appareils, ou, si elle est programmable, seule une application pouvant contenir les différents programmes est créée. L'application ne peut pas être supprimée ni ajoutée. Du fait de la liaison fixe qui existe entre l'appareil et l'application, tous deux sont toujours sélectionnés ensemble dans l'arboresence de projet du navigateur de dépôt